Ciao,
non capisco la distinzione che fai fra marche e produttori, non torvo da nessuna parte ( a meno di un recente aggiornamento, io sono sulla 1.6.0.9) il campo "Marca". Ci sono produttori e fornitori e il campo produttore lo usi per quello che vuoi fare tu.
PS ha già un elenco di tutti i produttori (di solito www.miosito.it/it/produttori) che ti consente di mostrare l'elenco di tutti i produttori e puoi mettere il relativo link dove vuoi.
Circa il secondo quesito, ossia filtrare i prodotti per produttore, usa il modulo "navigazione a strati".