Ciao Italo,
anche se il titolo di questo post parla di problemi infiniti dopo aggiornamento a PS 1.6.11, se leggi i primi interventi, si tratta di un aggiornamento decisamente hard (...dalla 1.4.x).
E poi intervenire su un post dichiarato risolto potrebbe non richiamare l'attenzione sperata.
Rispetto al tuo quesito, considerando che a parità di versione, l'ultimo upgrade minore è generalmente più maturo dei precedenti, io aggiornerei alla ultima versione 1.6, che ora è la 1.6.1.14.
Io, quando non sono certo che tutto vada bene, più che un backup (indispensabile se non vuoi brutte sorprese), faccio proprio un 'clone' del negozio, sullo stesso server del sito, in una sottocartella p.es. 'clone' o 'bis' e ovviamente con un nuovo d.base. Una volta effettuate le procedure per far funzionare il clone, provo ad effettuare qui il mio upgrade.
Una volta soddisfatto del risultato decido se trasformare il clone nel negozio principale, o ripetere la procedura sul negozio principale.