hola, no habia notado que prestashop te deja poner la misma referencia en los productos, no tiene sentido, pero tambien pensando en mi interior porque tienes 2 productos con la misma referencia?
si subes los productos via csv prestashop deberia de sobreescribir el producto que tiene la misma referencia para actualizarlo.
y una salida podria ser usar excel para identifique datos repetidos.
de todas formas me parece buen punto, si debería de saltar una advertencia cuando subo la misma referencia