Los hooks vacíos no aparecen en "Diseño -> Posiciones". Tienes que asociar un módulo al hook para que lo veas en la lista. Es lógico, esa lista se supone que es para mover y cambiar el orden de los módulos dentro de los hooks, por lo que los que están vacíos no tiene mucho sentido que aparezcan.
Si la intención es mover alguno de los módulos registrados en otro hook sin embargo debería funcionar, le das al botón "modificar" y ahí en la lista debería salirte el nuevo si lo has hecho bien.