Pour ceux que ça intéresse, il suffit de remplacer dans tools/tcpdf la version actuelle 5.9.179 par la dernière version 5 à savoir la 5.9.209 pour que cela refonctionne et que les PNG reviennent à la couleur 😉
Cela refonctionne à partir de la version 5.6.206 dont le changelog dit :
- Bug item #754 "PNG with alpha channel becomes gray scale" was fixed.
https://sourceforge.net/projects/tcpdf/files/OldFiles/
Comme cela date du 22/02/2013 je n'ai aucune idée de pourquoi cela fonctionnait jusqu'à maintenant...