Es posible que el módulo haya hecho algún cambio en el archivo .htaccess. Revísalo, o incluso prueba a renombrarlo y crear uno nuevo, desactivando y volviendo a activar las urls amigables desde el menú SEO de Prestashop.
Dicho sea de paso, odio este tipo de módulos que cambian sustancialmente el funcionamiento de las rutas de un CMS (en este caso Prestashop), para adaptarlo a una "moda" con el pretexto de una supuesta mejora en el posicionamiento en los buscadores si se eliminan los IDs en las URLs. La razón por la que es mejor una URL sin ID que una con él, nadie me la ha explicado nunca, aunque siempre te encuentras con gente que te asegura que hay que cambiarlo.