Ése módulo ha sido rehecho desde cero, y han cambiado bastantes cosas, incluidas las plantillas de las vistas. Es posible que en ciertos temas "antiguos" no funcione como se espera, ya que las clases que usan los elementos y demás han cambiado respecto a las versiones anteriores.
La buena noticia es que se puede adaptar con pocas modificaciones para que vuelva a funcionar en tu tema. La mala, es que debe hacerlo alguien que sepa un poco de HTML y de cómo funcionan los temas y plantillas de Prestashop.
Haz esta prueba: Mira a ver si existen los archivos /themes/nombre-de-tu-tema/modules/ps_facetedsearch/ps_facetedsearch.tpl y /themes/nombre-de-tu-tema/modules/ps_facetedsearch/views/templates/front/catalog/facets.tpl. Si es así, renómbralos (por ejemplo, como "facets_old.tpl"), borra caché y mira a ver qué pasa...