Buenos días,
Lo mejor es que te conectes a la bbdd haciendo uso de la api de Prestashop, y no mediante php puro.
Por ejemplo, un fichero mifichero.php, situado en la raíz de tu Prestashop:
require_once "config/config.inc.php";
require_once "init.php";
$id_producto = 1;
$sql = 'UPDATE '._DB_PREFIX_.'product SET `available_for_order` = 1 WHERE id_product='.$id_producto;
Db::getInstance()->execute($sql);
Ese código actualizaría el producto con id 1, estableciéndolo como disponible para pedidos...
Espero que te ayude.
Saludos.